Los pilares centrales del proyecto educativo de la ikastola Ander Deuna son los siguientes: una educación basada en la confianza y en una pedagogía avanzada; una comunidad para poder participar mano a mano en el proyecto; el papel central que tienen el euskera y la cultura vasca; la conexión con la comarca y con la naturaleza; y su participación en la red de ikastolas del País Vasco.